高速公路联网收费系统以“统一收费、按路段拆帐”的管理方式为标准，依据“统筹规划、统一标准、联网运营、统一清算”的原则进行设计开发，系统以非接触式IC卡作为通行券，实现对封闭式高速公路路网的通行车辆收费管理的功能。
高速公路联网收费清分结算管理系统完成高速公路现金、电子支付等多种类型收费数据的处理，最终实现高速公路通行费的全省统一清分、结算。
预付卡分为储值卡和记账卡两种，司机通过收费道口时，可以使用预付卡支付通行费，电子支付系统根据消费信息从账户上进行通行费的扣减、进行消费结算。本项目支持ETC电子不停车收费，并兼容基于IC卡作为通行券的人工收费（MTC）。
高速公路IC卡管理系统主要对省中心实施IC卡采购、初始化、客户化、调配、动态跟踪等。全省的IC卡密钥系统由省收费结算中心统一管理。储值卡、记账卡的发行、充值等管理工作统一由省结算中心负责，各路网中心和路段收费中心设立发售的网点。
为了提高收费站通行能力，皖通科技研发了ETC（Electronic Toll Collection）车道收费系统，它的最大特点是不停车收费，即车辆可以以相当高的速度通过收费口，无须在收费站前减速和停车交费。采用不停车收费系统，可以使公路收费走向无纸化、无现金化管理，可以从根本上杜绝收费票款的流失现象，解决公路收费中的财务管理混乱问题。
高速公路收费站在建设之后，其通行能力都有设计上限，随着车流量的不断增加，对于车道数较少的收费站，通行能力的瓶颈逐级显现，特别是在车流高峰期或者其它车道收费系统故障瘫痪时都会引起短时间内收费站车辆大量拥堵排队的情况出现。